大脑是体内代谢最活跃的器官之一。由于 PQQ 具有刺激线粒体生长的能力，研究人员认为它应该对认知和大脑健康产生有益影响。线粒体生物发生已被确定为防止神经变性和认知能力下降的关键。
根据《Adv Exp MedBiol.》（实验医学与生物学进展杂志）2016.08.报道的一项研究，41名健康的老年受试者被随机分配接受每天20mg的 PQQ ，持续12周或安慰剂。与安慰剂相比，补充 PQQ 与注意力和工作记忆的显著改善以及额叶脑血流量的增加相关。对于健忘的老年人（自我识别或由家人或熟人识别），相同的 PQQ 剂量导致8周后记忆测试分数的提高。
研究人员还发现证据表明 PQQ 可能会减缓严重神经退行性疾病的进展，包括阿尔茨海默症和帕金森症，甚至完全预防它们。这是因为，除了增强线粒体功能外， PQQ 还被发现可以防止异常蛋白的积累。与这些疾病相关的蛋白质（如β-淀粉样蛋白和α-突触核蛋白）。
此外， PQQ 可防止这些异常蛋白质损害大脑功能的毒性作用。例如，暴露于淀粉样蛋白的细胞通常会表现出氧化应激和细胞死亡。在一项研究中， PQQ 治疗显著逆转了这些影响，有助于保持脑细胞的活力和健康。这表明 PQQ 具有阻止各种痴呆症发展的巨大潜力。